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生物醫(yī)學(xué)科學(xué)家通常會(huì)經(jīng)常檢查實(shí)驗(yàn)室的細(xì)胞系是否被污染或貼錯(cuò)標(biāo)簽,但近日一項(xiàng)研究結(jié)果顯示,驗(yàn)證細(xì)胞身份的任何努力或許就相當(dāng)于進(jìn)行細(xì)胞比較的參考標(biāo)準(zhǔn)一樣。
8月31日刊登在雜志Science Translational Medicine上的一項(xiàng)研究報(bào)告中,來(lái)自美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所的研究人員通過(guò)研究指出,被廣泛用來(lái)研究腦癌的細(xì)胞系或許并不能匹配得上大約50年前創(chuàng)建的細(xì)胞系或據(jù)稱為源頭的腫瘤細(xì)胞;實(shí)際上,并沒有人能夠確切知道大多數(shù)細(xì)胞存儲(chǔ)庫(kù)所儲(chǔ)藏的細(xì)胞系的真正來(lái)源。
研究者Jon Lorsch說(shuō)道,質(zhì)疑你的假設(shè)并且盡可能地確保實(shí)驗(yàn)中進(jìn)行合適的控制,或許就能夠確保我們真的擁有那些我們所想的東西;來(lái)自美國(guó)科羅拉多大學(xué)丹佛分校( University of Colorado Denver )的研究者Christopher Korch指出,由于很少有細(xì)胞系曾經(jīng)被驗(yàn)證用來(lái)對(duì)抗原始的來(lái)源物質(zhì),因此這篇研究?jī)H僅是冰山一角。
目前很多研究團(tuán)隊(duì)都在盡力去解決被錯(cuò)誤識(shí)別的細(xì)胞系,以求改善研究結(jié)果的可重復(fù)性,今年美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院就開始要求經(jīng)費(fèi)申請(qǐng)人描述他們?nèi)绾悟?yàn)證實(shí)驗(yàn)室中的細(xì)胞系,而且諸如Nature等雜志近來(lái)也開始要求作者在475個(gè)細(xì)胞系組成的數(shù)據(jù)庫(kù)中來(lái)檢查他們所使用的細(xì)胞系。
目前并沒有組織要求的研究能夠給出這類檔案資料,因此這就很難讓研究者進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)的驗(yàn)證了,此外研究者還發(fā)現(xiàn),很多從事生命科學(xué)研究的科學(xué)家在其研究過(guò)程中并不會(huì)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行驗(yàn)證。
被弄錯(cuò)的身份
研究者提出疑問(wèn)的細(xì)胞系—U87,就是1966年由瑞典烏普薩拉大學(xué)的研究者所建立的,研究者利用來(lái)自44歲患膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的女性機(jī)體的組織建立了U87細(xì)胞系,從那時(shí)開始U87就成為了腦癌研究的“重要工具”,至今研究者已經(jīng)相繼發(fā)表了大約2000篇研究報(bào)告。對(duì)U87的研究熱情zui初讓腫瘤生物學(xué)家Bengt Westermark非常疑惑,他表示,我并不理解為何人們要利用這么“無(wú)聊”的細(xì)胞來(lái)進(jìn)行研究,20世紀(jì)70年代,作為一名畢業(yè)生,Westermark對(duì)8種不同的腦癌細(xì)胞系進(jìn)行了研究,他認(rèn)為利用U87并不能幫助研究,因?yàn)橄啾绕渌?xì)胞而言,U87的生長(zhǎng)非常緩慢。
多年以后,研究者Bengt Westermark基于U87開發(fā)出了處于自己的版本,而且目前由美國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心(ATCC)配給,研究者能夠觀察到U87細(xì)胞系的生長(zhǎng)特性,而且U87明顯不同于其此前研究過(guò)的細(xì)胞系,因此Westermark決定開始研究進(jìn)行一個(gè)正式的比較。很幸運(yùn)的是,烏普薩拉大學(xué)目前仍然保存著能夠產(chǎn)生原始細(xì)胞系的腫瘤組織,這就能夠幫助研究者Westermark來(lái)驗(yàn)證U87樣本的身份,隨后研究者利用DNA指紋技術(shù)發(fā)現(xiàn),ATCC中的U87細(xì)胞系不同于烏普薩拉大學(xué)保存的細(xì)胞系,而且同烏普薩拉大學(xué)保存的任何一種類型的細(xì)胞系并不能匹配得上。
培養(yǎng)的改變
據(jù)ATCC科學(xué)技術(shù)總監(jiān)Mindy Goldsborough表示,1982年ATCC獲得了來(lái)自紐約市斯隆凱特林癌癥紀(jì)念中心的U87細(xì)胞系,而該中心于1973年接收了來(lái)自烏普薩拉大學(xué)的細(xì)胞系;從那時(shí)候開始U87就進(jìn)入了ATCC,U87細(xì)胞中有一個(gè)Y染色體,盡管實(shí)際上該細(xì)胞系被認(rèn)為來(lái)自女性的機(jī)體,這或許就表明,細(xì)胞的混亂很有可能發(fā)生在斯隆凱特林癌癥紀(jì)念中心或細(xì)胞轉(zhuǎn)接的過(guò)程中。
鑒于的研究數(shù)據(jù),目前ATCC開始計(jì)劃更新其目錄上U87細(xì)胞系的背景資料(研究者將其描述為來(lái)自于男性機(jī)體),但U87的真正來(lái)源至今仍然是個(gè)謎。Westermark的研究小組進(jìn)行了一項(xiàng)基因特性的對(duì)比,結(jié)果表明,ATCC的細(xì)胞系很有可能來(lái)自于腦部腫瘤中,這或許是一個(gè)壞消息,因?yàn)樵摷?xì)胞系實(shí)際上并不是其應(yīng)該成為的細(xì)胞系,但同時(shí)這或許又是一個(gè)好消息,因?yàn)槠浜苡锌赡軄?lái)自于膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中,這就意味著,對(duì)U87的研究或許就能夠深入探究腦癌生物學(xué)的機(jī)制,同時(shí)并不需要“扔掉”該細(xì)胞系。
如今很多科學(xué)家都認(rèn)為是時(shí)候超越U87和其它經(jīng)典細(xì)胞系了,而不管這些細(xì)胞來(lái)自哪里,因?yàn)閺睦碚撋蟻?lái)講用于細(xì)胞生長(zhǎng)的培養(yǎng)條件就能夠改變細(xì)胞的生物學(xué)特性,研究者Westermark等人非常關(guān)心在生長(zhǎng)培養(yǎng)基上能夠持續(xù)繁殖的新型細(xì)胞系,而且這些細(xì)胞系能夠確保遺傳和表觀遺傳學(xué)的穩(wěn)定性,通過(guò)人類神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞培養(yǎng)生物樣本庫(kù)數(shù)據(jù),烏普薩拉大學(xué)已經(jīng)以較少的手續(xù)費(fèi)將這類細(xì)胞提供給其它的研究者來(lái)使用了。
zui后,來(lái)自紐約市威爾康奈爾腦瘤中心的神經(jīng)腫瘤學(xué)家Howard Fine表示,如今我們已經(jīng)能夠越來(lái)越多地理解我們此前使用的細(xì)胞系或許并不能很好地代表人類疾病的發(fā)病狀況,因此任何時(shí)候只要有人能夠駁倒U87細(xì)胞系的使用,我是非常高興的。